sklearn.cross_decomposition.PLSRegression¶
class sklearn.cross_decomposition.PLSRegression(n_components=2, *, scale=True, max_iter=500, tol=1e-06, copy=True)[source]
PLS回归
PLSRegression实现一维响应时称为PLS2或PLS1的PLS 2块回归。 此类继承_PLS,其mode=”A”,deflation_mode =“regression”,norm_y_weights = False且algorithm=“ nipals”。
在用户指南中阅读更多内容。
0.8版的新功能。
参数 | 说明 |
---|---|
n_components | int, (default 2) 要保留的组件数。 |
scale | boolean, (default True) 是否收缩数据 |
max_iter | an integer, (default 500) NIPALS内循环的最大迭代次数(仅当algorithm =“ nipals”时使用) |
tol | non-negative real 迭代算法中使用的公差默认为1e-06。 |
copy | boolean, default True 是否应在副本上进行收缩。 除非您不担心副作用,否则将默认值设为True |
属性 | 说明 |
---|---|
x_weights_ | array, [p, n_components] X块的权重向量。 |
y_weights_ | array, [q, n_components] Y块的权重向量。 |
x_loadings_ | array, [p, n_components] X块的加载向量。 |
y_loadings_ | array, [q, n_components] Y块的加载向量。 |
x_scores_ | array, [n_samples, n_components] X得分。 |
y_scores_ | array, [n_samples, n_components] Y得分。 |
x_rotations_ | array, [p, n_components] X块的潜在旋转。 |
y_rotations_ | array, [q, n_components] Y块的潜在旋转。 |
coef_ | array, [p, q] 线性模型的系数:Y = X coef_ + Err |
n_iter_ | array-like 每个组件的NIPALS内部循环的迭代次数。 |
注
矩阵:
T: x_scores_
U: y_scores_
W: x_weights_
C: y_weights_
P: x_loadings_
Q: y_loadings_
计算如下:
X = T P.T + Err and Y = U Q.T + Err
T[:, k] = Xk W[:, k] for k in range(n_components)
U[:, k] = Yk C[:, k] for k in range(n_components)
x_rotations_ = W (P.T W)^(-1)
y_rotations_ = C (Q.T C)^(-1)
其中Xk和Yk是迭代k的残差矩阵。
对于每个分量k,找到优化的权重u,v:
max corr(Xk u,Yk v)* std(Xk u)std(Yk u),使得| u | = 1
注意,它使得分和块内方差之间的相关性最大化。
X(Xk + 1)块的残差矩阵是通过对当前X分数x_score的收缩获得的。
Y(Yk + 1)块的残差矩阵是通过对当前X分数进行收缩获得的。这将执行称为PLS2的PLS回归。该模式是面向预测的。
此实现与R语言提供的3个PLS包(R项目)提供的结果相同:
带函数pls(X,Y,mode =“regression”)的“mixOmics”
带函数plsreg2(X,Y)的“plspm”
带函数oscorespls.fit(X,Y)的“pls”
参考资料
Jacob A. Wegelin. A survey of Partial Least Squares (PLS) methods, with emphasis on the two-block case. Technical Report 371, Department of Statistics, University of Washington, Seattle, 2000.
法语版但仍然可以参考: Tenenhaus, M. (1998). La regression PLS: theorie et pratique. Paris: Editions Technic.
示例
>>> from sklearn.cross_decomposition import PLSRegression
>>> X = [[0., 0., 1.], [1.,0.,0.], [2.,2.,2.], [2.,5.,4.]]
>>> Y = [[0.1, -0.2], [0.9, 1.1], [6.2, 5.9], [11.9, 12.3]]
>>> pls2 = PLSRegression(n_components=2)
>>> pls2.fit(X, Y)
PLSRegression()
>>> Y_pred = pls2.predict(X)
方法 | 说明 |
---|---|
fit (self, X, Y) |
训练数据模型 |
fit_transform (self, X[, y]) |
在训练集上学习并应用降维 |
get_params (self[, deep]) |
获取此估计量的参数。 |
inverse_transform (self, X) |
将数据转换回其原始空间。 |
predict (self, X[, copy]) |
应用在训练集上学到的降维。 |
score (self, X, y[, sample_weight]) |
返回预测的确定系数R^2。 |
set_params (self, **params) |
设置此估算器的参数。 |
transform (self, X[, Y, copy]) |
应用在训练集上学到的降维。 |
__init__(self, n_components=2, *, scale=True, max_iter=500, tol=1e-06, copy=True)
初始化self。有关准确的签名,请参见help(type(self))。
fit(self, X, Y)
训练数据。
参数 | 说明 |
---|---|
X | array-like of shape (n_samples, n_features) 训练向量,其中n_samples是样本数,n_features是预测变量数。 |
Y | array-like of shape (n_samples, n_targets) 目标向量,其中n_samples是样本数,n_targets是响应变量数。 |
fit_transform(self, X, y=None)
在训练集上学习并应用降维。
参数 | 说明 |
---|---|
X | array-like of shape (n_samples, n_features) 训练向量,其中n_samples是样本数,n_features是预测变量数。 |
y | array-like of shape (n_samples, n_targets) 目标向量,其中n_samples是样本数,n_targets是响应变量数。 |
返回值 | 说明 |
---|---|
如果未指定Y,则为x_scores,否则为(x_scores,y_scores)。 | - |
get_params(self, deep=True)
获取此估计量的参数。
参数 | 说明 |
---|---|
deep | bool, default=True 如果为True,则将返回此估算器和作为估算器的所包含子对象的参数。 |
返回值 | 说明 |
---|---|
params | mapping of string to any 参数名称映射到其值。 |
inverse_transform(self, X)
将数据转换回其原始空间。
参数 | 说明 |
---|---|
X | array-like of shape (n_samples, n_components) 新数据,其中n_samples是样本数,n_components是pls分量数。 |
返回值 | 说明 |
---|---|
x_reconstructed | array-like of shape (n_samples, n_features) |
注
仅当n_components = n_features时,此转换才是精确的
predict(self, X, copy=True)
参数 | 说明 |
---|---|
X | array-like of shape (n_samples, n_features) 训练向量,其中n_samples是样本数,n_features是预测变量数。 |
copy | boolean, default True 是复制X和Y,还是执行就地归一化。 |
注
该调用需要估计p x q矩阵,这在高维空间中可能是个问题。
score(self, X, y, sample_weight=None)
返回预测的确定系数R^2。
系数R^2定义为(1- u / v),其中u是平方的残差和((y_true-y_pred)** 2).sum(),而v是平方的总和((y_true- y_true.mean())** 2).sum()。 可能的最高得分为1.0,并且可能为负(因为该模型可能会更差)。 不管输入特征如何,常数模型始终预测y的期望值将获得0.0的R^2分数。
参数 | 说明 |
---|---|
X | array-like of shape (n_samples, n_features) 测试样本。 对于某些估计量,可以是预先计算的内核矩阵或通用对象列表,shape =(n_samples,n_samples_fitted),其中n_samples_fitted是用于估计量拟合的样本数。 |
y | array-like of shape (n_samples,) or (n_samples, n_outputs) X的真实值。 |
sample_weight | array-like of shape (n_samples,), default=None 样本权重。 |
返回值 | 说明 |
---|---|
score | float self.predict(X)对于y的R^2 |
注
使用版本0.23的multioutput ='uniform_average'在回归器上调用score时,使用的R2分数,来保持与r2_score的默认值一致。 这会影响所有多输出回归器的score方法(MultiOutputRegressor除外)。
set_params(self, **params)
设置此估算器的参数。
该方法适用于简单的估计器以及嵌套对象(例如管道)。 后者的参数格式为<component> __ <parameter>
,以便可以更新嵌套对象的每个组件。
参数 | 说明 |
---|---|
**params | dict 估算器参数。 |
返回值 | 说明 |
---|---|
self | object 估算器实例。 |
transform(self, X, Y=None, copy=True)
应用在训练集上学到的降维。
参数 | 说明 |
---|---|
X | array-like of shape (n_samples, n_features) 训练向量,其中n_samples是样本数,n_features是预测变量数。 |
Y | array-like of shape (n_samples, n_targets) 目标向量,其中n_samples是样本数,n_targets是响应变量数。 |
copy | boolean, default True 是复制X和Y,还是直接执行规范化. |
返回值 |
---|
如果未指定Y,则为x_scores,否则为(x_scores,y_scores)。 |